L’Isola del Giglio, si trova all’interno dell'arcipelago toscano, distante circa 16 km dal Monte Argentario.
I collegamenti con la penisola avvengono attraverso i traghetti con imbarco a Porto Santo Stefano, gestiti dalle compagnie di navigazione Maregiglio e Toremar. Il Comune di Isola del Giglio comprende anche l'Isola di Giannutri, posta nella parte sud-est a pochi chilometri di distanza.